Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc130Q9D516 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc130Q9D516 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms