Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q9D4W2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q9D4W2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms