Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tomm20lQ9D4V6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tomm20lQ9D4V6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms