Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ccdc83Q9D4V3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc83Q9D4V3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms