Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
4930578G10RikQ9D4Q4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
4930578G10RikQ9D4Q4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms