Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sohlh2Q9D489 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms