Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D454 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D454 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D454 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D454 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D454 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D454 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D454 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D454 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms