Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
4933425L06RikQ9D3Z8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms