Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx29Q9D3S3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx29Q9D3S3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms