Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms