Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pramef12Q9D2F1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms