Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snapc3Q9D2C9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snapc3Q9D2C9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms