Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Batf3Q9D275 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Batf3Q9D275 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Batf3Q9D275 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Batf3Q9D275 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Batf3Q9D275 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms