Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Chordc1Q9D1P4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chordc1Q9D1P4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms