Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SarnpQ9D1J3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms