Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D1F3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D1F3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms