Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Lmbr1lQ9D1E5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lmbr1lQ9D1E5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms