Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd3Q9D176 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms