Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Hddc3Q9D114 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Hddc3Q9D114 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Hddc3Q9D114 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hddc3Q9D114 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hddc3Q9D114 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.6 ms