Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem53Q9D0Z3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms