Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C4

Trmt5, tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt5Q9D0C4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trmt5Q9D0C4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms