Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Thumpd2Q9CZB3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thumpd2Q9CZB3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thumpd2Q9CZB3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thumpd2Q9CZB3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Thumpd2Q9CZB3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms