Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Snf8Q9CZ28 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms