Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2fQ9CY34 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms