Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Exo5Q9CXP9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms