Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sgo1Q9CXH7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sgo1Q9CXH7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sgo1Q9CXH7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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