Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmed5Q9CXE7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmed5Q9CXE7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms