Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc2Q9CX47 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Xrcc2Q9CX47 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms