Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cxxc1Q9CWW7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms