Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9CWU4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms