Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ly6kQ9CWP4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms