Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cnot11Q9CWN7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Cnot11Q9CWN7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Cnot11Q9CWN7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnot11Q9CWN7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnot11Q9CWN7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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