Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdca4Q9CWM2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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