Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NubplQ9CWD8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NubplQ9CWD8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms