Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms