Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
4930535I16RikQ9CUI2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
4930535I16RikQ9CUI2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms