Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4930553M12RikQ9CUH1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms