Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PclafQ9CQX4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms