Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ykt6Q9CQW1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ykt6Q9CQW1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ykt6Q9CQW1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ykt6Q9CQW1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ykt6Q9CQW1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ykt6Q9CQW1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ykt6Q9CQW1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ykt6Q9CQW1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ykt6Q9CQW1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ykt6Q9CQW1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ykt6Q9CQW1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ykt6Q9CQW1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ykt6Q9CQW1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ykt6Q9CQW1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ykt6Q9CQW1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ykt6Q9CQW1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ykt6Q9CQW1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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