Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rer1Q9CQU3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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