Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trappc2Q9CQP2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc2Q9CQP2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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