Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ndufb9Q9CQJ8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ndufb9Q9CQJ8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms