Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms