Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trappc5Q9CQA1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trappc5Q9CQA1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms