Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
1700029P11RikQ9CQ68 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
1700029P11RikQ9CQ68 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms