Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lrrc18Q9CQ07 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lrrc18Q9CQ07 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms