Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Bhlhe41Q99PV5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms