Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prpf8Q99PV0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prpf8Q99PV0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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