Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ino80bQ99PT3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ino80bQ99PT3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms