Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim26Q99PN3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim26Q99PN3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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